多肽合成中偶聯(lián)效率的 “斷崖式下跌"原因以及應(yīng)對策略

在多肽固相合成中，肽鏈延長至一定長度后，部分氨基酸的偶聯(lián)難度會出現(xiàn) “突然躍升"，原因是肽鏈聚集效應(yīng)疊加氨基酸自身的空間位阻 / 極性特征，導致反應(yīng)位點被包裹、傳質(zhì)受阻。這類氨基酸可分為兩類：高疏水性氨基酸和易形成二級結(jié)構(gòu)的氨基酸，具體如下：

一、 高疏水性氨基酸：肽鏈延長后因聚集引發(fā)偶聯(lián)難度陡增

當肽鏈長度超過 8–10 個殘基時，疏水性氨基酸的側(cè)鏈會通過疏水作用驅(qū)動肽鏈在固相載體表面發(fā)生折疊聚集，使得末端氨基被包裹在疏水核心內(nèi)，活化羧基難以接近，偶聯(lián)效率驟降。

1.       亮氨酸（Leu）、異亮氨酸（Ile）、纈氨酸（Val）

突變特征：短肽（<6 殘基）中偶聯(lián)難度中等，但當肽鏈中連續(xù)出現(xiàn) 3 個及以上這類支鏈疏水氨基酸，或肽鏈總長度超過 10 殘基時，偶聯(lián)效率會從 80% 以上驟降至 40% 以下。

2.       苯丙氨酸（Phe）、色氨酸（Trp）

突變特征：肽鏈長度超過 8 殘基，且序列中存在 2 個以上芳香族殘基時，偶聯(lián)難度會突然升高；Trp 還會因聚集導致氧化風險同步增加。

二、 易形成二級結(jié)構(gòu)的氨基酸：肽鏈延長后因構(gòu)象固定引發(fā)偶聯(lián)難度突變

部分氨基酸易誘導肽鏈形成 α- 螺旋、β- 折疊等二級結(jié)構(gòu)，當肽鏈延長至能穩(wěn)定二級結(jié)構(gòu)的長度時，末端構(gòu)象被固定，氨基活性位點難以與活化酯接觸，偶聯(lián)難度突然上升。

1.       α- 氨基異丁酸（Aib）、丙氨酸（Ala）

突變特征：Aib 是強 α- 螺旋誘導劑，會快速形成穩(wěn)定 α- 螺旋，導致后續(xù)偶聯(lián)效率驟降。Ala 雖短肽中偶聯(lián)極易，但在長肽中形成 α- 螺旋后，偶聯(lián)難度也會顯著上升。

2.       脯氨酸（Pro）

突變特征：短肽中 Pro 偶聯(lián)難度高，但仍可通過高活性試劑解決；當肽鏈長度超過 8 殘基且含 Pro-Pro 序列時，偶聯(lián)難度會突然躍升，甚至出現(xiàn)肽鏈延伸停滯。

3.       谷氨酸（Glu）、賴氨酸（Lys）

突變特征：在長肽（>12 殘基）中，帶電荷的 Glu/Lys 易通過離子鍵交聯(lián)形成聚集體，尤其當序列中正負電荷殘基比例失衡時，偶聯(lián)難度會突然升高。

應(yīng)對策略：

1.       添加助溶劑：在 DMF 中加入 10%–30% DMSO 或 NMP，破壞肽鏈疏水聚集，提高反應(yīng)位點可及性。

2.       微波輔助技術(shù)：

通過微波能量與特殊環(huán)形電磁場的協(xié)同作用，讓卷曲的肽鏈充分展開，打破疏水聚集與二級結(jié)構(gòu)的束縛，使反應(yīng)位點更易被活化試劑接觸，從而顯著降低因肽鏈延長、氨基酸聚集或構(gòu)象固定導致的偶聯(lián)難度突變。同時，微波的快速能量耦合與精準控溫，既能加速偶聯(lián)反應(yīng)、縮短時間，又能減少氧化、消旋等副反應(yīng)，有效提升長肽與難點氨基酸序列的合成效率與產(chǎn)物純度。

3.       微波方法優(yōu)化：對于難偶聯(lián)氨基酸循環(huán)，將方法中偶聯(lián)次數(shù)翻倍。

CEM Liberty 2.0 系列堪稱當前多肽合成的最1優(yōu)解決方案，憑借核心技術(shù)突破實現(xiàn)全1方位革新。它攻克長難肽合成瓶頸，4 分鐘即可完成單個氨基酸循環(huán)，即便是 86 個氨基酸的胰島素原等復雜序列也能高效合成，較傳統(tǒng)方法速度提升 25 倍；粗肽純度實現(xiàn)質(zhì)的飛躍，困難肽合成粗純度可達 68% 以上，部分標準序列更是高達 98%，大幅降低后續(xù)純化成本；同時依托免清洗專1利技術(shù)，廢液生成量較傳統(tǒng)工藝減少 95%，每添加一個氨基酸僅產(chǎn)生不足 6ml 廢液，既契合環(huán)保合規(guī)要求，又顯著降低綜合運行成本。